Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGAP28Q9P2N2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGAP28Q9P2N2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGAP28Q9P2N2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP28Q9P2N2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP28Q9P2N2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGAP28Q9P2N2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGAP28Q9P2N2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGAP28Q9P2N2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGAP28Q9P2N2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGAP28Q9P2N2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGAP28Q9P2N2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGAP28Q9P2N2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGAP28Q9P2N2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGAP28Q9P2N2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGAP28Q9P2N2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGAP28Q9P2N2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGAP28Q9P2N2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGAP28Q9P2N2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGAP28Q9P2N2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGAP28Q9P2N2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGAP28Q9P2N2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGAP28Q9P2N2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP28Q9P2N2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP28Q9P2N2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP28Q9P2N2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP28Q9P2N2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP28Q9P2N2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP28Q9P2N2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP28Q9P2N2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP28Q9P2N2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP28Q9P2N2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP28Q9P2N2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGAP28Q9P2N2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGAP28Q9P2N2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGAP28Q9P2N2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGAP28Q9P2N2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
ARHGAP28Q9P2N2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGAP28Q9P2N2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGAP28Q9P2N2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGAP28Q9P2N2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGAP28Q9P2N2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGAP28Q9P2N2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGAP28Q9P2N2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGAP28Q9P2N2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGAP28Q9P2N2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGAP28Q9P2N2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGAP28Q9P2N2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGAP28Q9P2N2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGAP28Q9P2N2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGAP28Q9P2N2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGAP28Q9P2N2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGAP28Q9P2N2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGAP28Q9P2N2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGAP28Q9P2N2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGAP28Q9P2N2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGAP28Q9P2N2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGAP28Q9P2N2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGAP28Q9P2N2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGAP28Q9P2N2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGAP28Q9P2N2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ARHGAP28Q9P2N2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGAP28Q9P2N2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms