Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPZ2Q9P299 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPZ2Q9P299 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPZ2Q9P299 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPZ2Q9P299 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPZ2Q9P299 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPZ2Q9P299 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPZ2Q9P299 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPZ2Q9P299 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPZ2Q9P299 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COPZ2Q9P299 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPZ2Q9P299 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COPZ2Q9P299 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPZ2Q9P299 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPZ2Q9P299 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPZ2Q9P299 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPZ2Q9P299 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPZ2Q9P299 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPZ2Q9P299 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPZ2Q9P299 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPZ2Q9P299 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPZ2Q9P299 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPZ2Q9P299 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPZ2Q9P299 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPZ2Q9P299 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPZ2Q9P299 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPZ2Q9P299 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPZ2Q9P299 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPZ2Q9P299 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPZ2Q9P299 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPZ2Q9P299 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COPZ2Q9P299 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPZ2Q9P299 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPZ2Q9P299 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPZ2Q9P299 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPZ2Q9P299 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPZ2Q9P299 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPZ2Q9P299 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPZ2Q9P299 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPZ2Q9P299 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPZ2Q9P299 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPZ2Q9P299 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPZ2Q9P299 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPZ2Q9P299 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPZ2Q9P299 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPZ2Q9P299 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPZ2Q9P299 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPZ2Q9P299 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPZ2Q9P299 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPZ2Q9P299 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPZ2Q9P299 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPZ2Q9P299 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPZ2Q9P299 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPZ2Q9P299 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPZ2Q9P299 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPZ2Q9P299 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPZ2Q9P299 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPZ2Q9P299 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPZ2Q9P299 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPZ2Q9P299 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPZ2Q9P299 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPZ2Q9P299 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPZ2Q9P299 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPZ2Q9P299 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPZ2Q9P299 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COPZ2Q9P299 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPZ2Q9P299 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPZ2Q9P299 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPZ2Q9P299 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPZ2Q9P299 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPZ2Q9P299 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPZ2Q9P299 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPZ2Q9P299 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms