Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
HMG20BQ9P0W2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HMG20BQ9P0W2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
HMG20BQ9P0W2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
HMG20BQ9P0W2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HMG20BQ9P0W2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HMG20BQ9P0W2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HMG20BQ9P0W2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
HMG20BQ9P0W2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HMG20BQ9P0W2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HMG20BQ9P0W2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HMG20BQ9P0W2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HMG20BQ9P0W2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
HMG20BQ9P0W2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
HMG20BQ9P0W2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HMG20BQ9P0W2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HMG20BQ9P0W2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HMG20BQ9P0W2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HMG20BQ9P0W2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMG20BQ9P0W2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMG20BQ9P0W2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMG20BQ9P0W2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMG20BQ9P0W2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMG20BQ9P0W2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMG20BQ9P0W2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HMG20BQ9P0W2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMG20BQ9P0W2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HMG20BQ9P0W2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HMG20BQ9P0W2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HMG20BQ9P0W2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
HMG20BQ9P0W2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HMG20BQ9P0W2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HMG20BQ9P0W2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HMG20BQ9P0W2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HMG20BQ9P0W2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HMG20BQ9P0W2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HMG20BQ9P0W2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
HMG20BQ9P0W2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
HMG20BQ9P0W2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
HMG20BQ9P0W2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HMG20BQ9P0W2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HMG20BQ9P0W2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HMG20BQ9P0W2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HMG20BQ9P0W2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HMG20BQ9P0W2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HMG20BQ9P0W2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HMG20BQ9P0W2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
HMG20BQ9P0W2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HMG20BQ9P0W2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HMG20BQ9P0W2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
HMG20BQ9P0W2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
HMG20BQ9P0W2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
HMG20BQ9P0W2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HMG20BQ9P0W2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
HMG20BQ9P0W2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HMG20BQ9P0W2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HMG20BQ9P0W2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
HMG20BQ9P0W2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HMG20BQ9P0W2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
HMG20BQ9P0W2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
HMG20BQ9P0W2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HMG20BQ9P0W2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HMG20BQ9P0W2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
HMG20BQ9P0W2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.87■■■□□ 2.69
HMG20BQ9P0W2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
HMG20BQ9P0W2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
HMG20BQ9P0W2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HMG20BQ9P0W2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HMG20BQ9P0W2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HMG20BQ9P0W2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
HMG20BQ9P0W2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HMG20BQ9P0W2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HMG20BQ9P0W2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HMG20BQ9P0W2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
HMG20BQ9P0W2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
HMG20BQ9P0W2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
HMG20BQ9P0W2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
HMG20BQ9P0W2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HMG20BQ9P0W2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
HMG20BQ9P0W2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms