Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD9Q9P000 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD9Q9P000 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD9Q9P000 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COMMD9Q9P000 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD9Q9P000 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD9Q9P000 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD9Q9P000 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD9Q9P000 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD9Q9P000 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD9Q9P000 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD9Q9P000 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD9Q9P000 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD9Q9P000 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COMMD9Q9P000 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COMMD9Q9P000 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COMMD9Q9P000 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COMMD9Q9P000 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COMMD9Q9P000 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD9Q9P000 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD9Q9P000 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD9Q9P000 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
COMMD9Q9P000 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COMMD9Q9P000 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD9Q9P000 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD9Q9P000 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD9Q9P000 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD9Q9P000 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD9Q9P000 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD9Q9P000 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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