Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR4

VSX1, Visual system homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1Q9NZR4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSX1Q9NZR4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VSX1Q9NZR4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSX1Q9NZR4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSX1Q9NZR4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSX1Q9NZR4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSX1Q9NZR4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSX1Q9NZR4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSX1Q9NZR4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSX1Q9NZR4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSX1Q9NZR4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VSX1Q9NZR4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSX1Q9NZR4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSX1Q9NZR4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSX1Q9NZR4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSX1Q9NZR4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSX1Q9NZR4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSX1Q9NZR4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSX1Q9NZR4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSX1Q9NZR4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSX1Q9NZR4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSX1Q9NZR4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSX1Q9NZR4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSX1Q9NZR4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSX1Q9NZR4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSX1Q9NZR4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSX1Q9NZR4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSX1Q9NZR4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSX1Q9NZR4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSX1Q9NZR4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSX1Q9NZR4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VSX1Q9NZR4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VSX1Q9NZR4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
VSX1Q9NZR4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VSX1Q9NZR4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSX1Q9NZR4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSX1Q9NZR4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSX1Q9NZR4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSX1Q9NZR4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSX1Q9NZR4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSX1Q9NZR4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSX1Q9NZR4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSX1Q9NZR4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSX1Q9NZR4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSX1Q9NZR4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSX1Q9NZR4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSX1Q9NZR4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSX1Q9NZR4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSX1Q9NZR4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSX1Q9NZR4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSX1Q9NZR4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSX1Q9NZR4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSX1Q9NZR4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSX1Q9NZR4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSX1Q9NZR4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSX1Q9NZR4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSX1Q9NZR4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSX1Q9NZR4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSX1Q9NZR4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSX1Q9NZR4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSX1Q9NZR4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSX1Q9NZR4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSX1Q9NZR4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSX1Q9NZR4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSX1Q9NZR4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSX1Q9NZR4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSX1Q9NZR4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSX1Q9NZR4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSX1Q9NZR4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSX1Q9NZR4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSX1Q9NZR4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSX1Q9NZR4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSX1Q9NZR4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSX1Q9NZR4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSX1Q9NZR4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSX1Q9NZR4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSX1Q9NZR4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSX1Q9NZR4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSX1Q9NZR4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSX1Q9NZR4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSX1Q9NZR4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSX1Q9NZR4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSX1Q9NZR4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSX1Q9NZR4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSX1Q9NZR4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSX1Q9NZR4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VSX1Q9NZR4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSX1Q9NZR4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSX1Q9NZR4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VSX1Q9NZR4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VSX1Q9NZR4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VSX1Q9NZR4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VSX1Q9NZR4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VSX1Q9NZR4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSX1Q9NZR4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSX1Q9NZR4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSX1Q9NZR4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSX1Q9NZR4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSX1Q9NZR4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSX1Q9NZR4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms