Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYOFQ9NZM1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYOFQ9NZM1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYOFQ9NZM1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYOFQ9NZM1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYOFQ9NZM1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MYOFQ9NZM1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MYOFQ9NZM1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYOFQ9NZM1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOFQ9NZM1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOFQ9NZM1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOFQ9NZM1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOFQ9NZM1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOFQ9NZM1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYOFQ9NZM1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYOFQ9NZM1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYOFQ9NZM1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYOFQ9NZM1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOFQ9NZM1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOFQ9NZM1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOFQ9NZM1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOFQ9NZM1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOFQ9NZM1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOFQ9NZM1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYOFQ9NZM1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYOFQ9NZM1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYOFQ9NZM1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYOFQ9NZM1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOFQ9NZM1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOFQ9NZM1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOFQ9NZM1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOFQ9NZM1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYOFQ9NZM1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYOFQ9NZM1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOFQ9NZM1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOFQ9NZM1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOFQ9NZM1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOFQ9NZM1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOFQ9NZM1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOFQ9NZM1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOFQ9NZM1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOFQ9NZM1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOFQ9NZM1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOFQ9NZM1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOFQ9NZM1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOFQ9NZM1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOFQ9NZM1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOFQ9NZM1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOFQ9NZM1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOFQ9NZM1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOFQ9NZM1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MYOFQ9NZM1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYOFQ9NZM1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYOFQ9NZM1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYOFQ9NZM1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYOFQ9NZM1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYOFQ9NZM1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MYOFQ9NZM1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYOFQ9NZM1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYOFQ9NZM1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYOFQ9NZM1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYOFQ9NZM1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYOFQ9NZM1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYOFQ9NZM1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYOFQ9NZM1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYOFQ9NZM1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYOFQ9NZM1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOFQ9NZM1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOFQ9NZM1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MYOFQ9NZM1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYOFQ9NZM1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms