Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NINJ2Q9NZG7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NINJ2Q9NZG7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NINJ2Q9NZG7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NINJ2Q9NZG7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NINJ2Q9NZG7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NINJ2Q9NZG7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NINJ2Q9NZG7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NINJ2Q9NZG7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NINJ2Q9NZG7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NINJ2Q9NZG7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NINJ2Q9NZG7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NINJ2Q9NZG7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NINJ2Q9NZG7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NINJ2Q9NZG7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NINJ2Q9NZG7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NINJ2Q9NZG7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NINJ2Q9NZG7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NINJ2Q9NZG7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NINJ2Q9NZG7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NINJ2Q9NZG7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NINJ2Q9NZG7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NINJ2Q9NZG7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NINJ2Q9NZG7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NINJ2Q9NZG7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NINJ2Q9NZG7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NINJ2Q9NZG7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NINJ2Q9NZG7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NINJ2Q9NZG7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NINJ2Q9NZG7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NINJ2Q9NZG7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NINJ2Q9NZG7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NINJ2Q9NZG7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NINJ2Q9NZG7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NINJ2Q9NZG7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NINJ2Q9NZG7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NINJ2Q9NZG7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NINJ2Q9NZG7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NINJ2Q9NZG7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NINJ2Q9NZG7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NINJ2Q9NZG7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NINJ2Q9NZG7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NINJ2Q9NZG7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NINJ2Q9NZG7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NINJ2Q9NZG7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NINJ2Q9NZG7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NINJ2Q9NZG7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NINJ2Q9NZG7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NINJ2Q9NZG7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NINJ2Q9NZG7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NINJ2Q9NZG7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NINJ2Q9NZG7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NINJ2Q9NZG7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NINJ2Q9NZG7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NINJ2Q9NZG7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NINJ2Q9NZG7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NINJ2Q9NZG7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NINJ2Q9NZG7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NINJ2Q9NZG7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NINJ2Q9NZG7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NINJ2Q9NZG7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NINJ2Q9NZG7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NINJ2Q9NZG7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NINJ2Q9NZG7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NINJ2Q9NZG7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NINJ2Q9NZG7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NINJ2Q9NZG7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NINJ2Q9NZG7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NINJ2Q9NZG7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NINJ2Q9NZG7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NINJ2Q9NZG7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NINJ2Q9NZG7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NINJ2Q9NZG7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NINJ2Q9NZG7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NINJ2Q9NZG7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NINJ2Q9NZG7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NINJ2Q9NZG7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NINJ2Q9NZG7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NINJ2Q9NZG7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINJ2Q9NZG7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINJ2Q9NZG7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NINJ2Q9NZG7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NINJ2Q9NZG7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NINJ2Q9NZG7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NINJ2Q9NZG7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NINJ2Q9NZG7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NINJ2Q9NZG7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NINJ2Q9NZG7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINJ2Q9NZG7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINJ2Q9NZG7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NINJ2Q9NZG7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NINJ2Q9NZG7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NINJ2Q9NZG7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NINJ2Q9NZG7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NINJ2Q9NZG7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NINJ2Q9NZG7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NINJ2Q9NZG7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NINJ2Q9NZG7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NINJ2Q9NZG7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NINJ2Q9NZG7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms