Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRNAU1APQ9NX07 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRNAU1APQ9NX07 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRNAU1APQ9NX07 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRNAU1APQ9NX07 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRNAU1APQ9NX07 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRNAU1APQ9NX07 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRNAU1APQ9NX07 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRNAU1APQ9NX07 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRNAU1APQ9NX07 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRNAU1APQ9NX07 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRNAU1APQ9NX07 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRNAU1APQ9NX07 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRNAU1APQ9NX07 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRNAU1APQ9NX07 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRNAU1APQ9NX07 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRNAU1APQ9NX07 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRNAU1APQ9NX07 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRNAU1APQ9NX07 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRNAU1APQ9NX07 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRNAU1APQ9NX07 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRNAU1APQ9NX07 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRNAU1APQ9NX07 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRNAU1APQ9NX07 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRNAU1APQ9NX07 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRNAU1APQ9NX07 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRNAU1APQ9NX07 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRNAU1APQ9NX07 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRNAU1APQ9NX07 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRNAU1APQ9NX07 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRNAU1APQ9NX07 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRNAU1APQ9NX07 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRNAU1APQ9NX07 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRNAU1APQ9NX07 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRNAU1APQ9NX07 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRNAU1APQ9NX07 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRNAU1APQ9NX07 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRNAU1APQ9NX07 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRNAU1APQ9NX07 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRNAU1APQ9NX07 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRNAU1APQ9NX07 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRNAU1APQ9NX07 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRNAU1APQ9NX07 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRNAU1APQ9NX07 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRNAU1APQ9NX07 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRNAU1APQ9NX07 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRNAU1APQ9NX07 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRNAU1APQ9NX07 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRNAU1APQ9NX07 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRNAU1APQ9NX07 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRNAU1APQ9NX07 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRNAU1APQ9NX07 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRNAU1APQ9NX07 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRNAU1APQ9NX07 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRNAU1APQ9NX07 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRNAU1APQ9NX07 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRNAU1APQ9NX07 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRNAU1APQ9NX07 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRNAU1APQ9NX07 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRNAU1APQ9NX07 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRNAU1APQ9NX07 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRNAU1APQ9NX07 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRNAU1APQ9NX07 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRNAU1APQ9NX07 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRNAU1APQ9NX07 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRNAU1APQ9NX07 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRNAU1APQ9NX07 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRNAU1APQ9NX07 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRNAU1APQ9NX07 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRNAU1APQ9NX07 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRNAU1APQ9NX07 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRNAU1APQ9NX07 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRNAU1APQ9NX07 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRNAU1APQ9NX07 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRNAU1APQ9NX07 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRNAU1APQ9NX07 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRNAU1APQ9NX07 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRNAU1APQ9NX07 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms