Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPTLC3Q9NUV7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPTLC3Q9NUV7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPTLC3Q9NUV7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPTLC3Q9NUV7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPTLC3Q9NUV7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPTLC3Q9NUV7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPTLC3Q9NUV7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SPTLC3Q9NUV7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPTLC3Q9NUV7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SPTLC3Q9NUV7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SPTLC3Q9NUV7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPTLC3Q9NUV7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SPTLC3Q9NUV7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPTLC3Q9NUV7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPTLC3Q9NUV7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPTLC3Q9NUV7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPTLC3Q9NUV7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPTLC3Q9NUV7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPTLC3Q9NUV7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPTLC3Q9NUV7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPTLC3Q9NUV7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SPTLC3Q9NUV7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPTLC3Q9NUV7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPTLC3Q9NUV7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPTLC3Q9NUV7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPTLC3Q9NUV7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPTLC3Q9NUV7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPTLC3Q9NUV7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPTLC3Q9NUV7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPTLC3Q9NUV7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPTLC3Q9NUV7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPTLC3Q9NUV7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPTLC3Q9NUV7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPTLC3Q9NUV7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPTLC3Q9NUV7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPTLC3Q9NUV7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPTLC3Q9NUV7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPTLC3Q9NUV7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPTLC3Q9NUV7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPTLC3Q9NUV7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPTLC3Q9NUV7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPTLC3Q9NUV7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPTLC3Q9NUV7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPTLC3Q9NUV7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPTLC3Q9NUV7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SPTLC3Q9NUV7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPTLC3Q9NUV7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPTLC3Q9NUV7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPTLC3Q9NUV7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPTLC3Q9NUV7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPTLC3Q9NUV7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPTLC3Q9NUV7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPTLC3Q9NUV7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPTLC3Q9NUV7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPTLC3Q9NUV7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPTLC3Q9NUV7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPTLC3Q9NUV7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPTLC3Q9NUV7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPTLC3Q9NUV7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPTLC3Q9NUV7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPTLC3Q9NUV7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SPTLC3Q9NUV7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPTLC3Q9NUV7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPTLC3Q9NUV7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPTLC3Q9NUV7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPTLC3Q9NUV7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPTLC3Q9NUV7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPTLC3Q9NUV7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPTLC3Q9NUV7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPTLC3Q9NUV7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPTLC3Q9NUV7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SPTLC3Q9NUV7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SPTLC3Q9NUV7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPTLC3Q9NUV7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPTLC3Q9NUV7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPTLC3Q9NUV7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPTLC3Q9NUV7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPTLC3Q9NUV7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPTLC3Q9NUV7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPTLC3Q9NUV7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPTLC3Q9NUV7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPTLC3Q9NUV7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPTLC3Q9NUV7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPTLC3Q9NUV7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPTLC3Q9NUV7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPTLC3Q9NUV7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPTLC3Q9NUV7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPTLC3Q9NUV7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPTLC3Q9NUV7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPTLC3Q9NUV7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPTLC3Q9NUV7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPTLC3Q9NUV7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPTLC3Q9NUV7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPTLC3Q9NUV7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPTLC3Q9NUV7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms