Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS26

SPANXA1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome A, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXA1Q9NS26 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXA1Q9NS26 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPANXA1Q9NS26 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXA1Q9NS26 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXA1Q9NS26 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXA1Q9NS26 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXA1Q9NS26 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXA1Q9NS26 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXA1Q9NS26 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXA1Q9NS26 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXA1Q9NS26 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXA1Q9NS26 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXA1Q9NS26 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXA1Q9NS26 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXA1Q9NS26 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXA1Q9NS26 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXA1Q9NS26 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXA1Q9NS26 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXA1Q9NS26 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPANXA1Q9NS26 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPANXA1Q9NS26 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPANXA1Q9NS26 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPANXA1Q9NS26 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXA1Q9NS26 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXA1Q9NS26 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXA1Q9NS26 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXA1Q9NS26 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPANXA1Q9NS26 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPANXA1Q9NS26 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPANXA1Q9NS26 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXA1Q9NS26 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXA1Q9NS26 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXA1Q9NS26 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXA1Q9NS26 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXA1Q9NS26 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXA1Q9NS26 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXA1Q9NS26 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXA1Q9NS26 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPANXA1Q9NS26 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPANXA1Q9NS26 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPANXA1Q9NS26 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPANXA1Q9NS26 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms