Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTPS2Q9NRF8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTPS2Q9NRF8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTPS2Q9NRF8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTPS2Q9NRF8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTPS2Q9NRF8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTPS2Q9NRF8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTPS2Q9NRF8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTPS2Q9NRF8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTPS2Q9NRF8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTPS2Q9NRF8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTPS2Q9NRF8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTPS2Q9NRF8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTPS2Q9NRF8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTPS2Q9NRF8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTPS2Q9NRF8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTPS2Q9NRF8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTPS2Q9NRF8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTPS2Q9NRF8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTPS2Q9NRF8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTPS2Q9NRF8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTPS2Q9NRF8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTPS2Q9NRF8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTPS2Q9NRF8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTPS2Q9NRF8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTPS2Q9NRF8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTPS2Q9NRF8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTPS2Q9NRF8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTPS2Q9NRF8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTPS2Q9NRF8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTPS2Q9NRF8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTPS2Q9NRF8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTPS2Q9NRF8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTPS2Q9NRF8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTPS2Q9NRF8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTPS2Q9NRF8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTPS2Q9NRF8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTPS2Q9NRF8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTPS2Q9NRF8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTPS2Q9NRF8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms