Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQE9

HINT3, Histidine triad nucleotide-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINT3Q9NQE9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HINT3Q9NQE9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HINT3Q9NQE9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HINT3Q9NQE9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HINT3Q9NQE9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HINT3Q9NQE9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HINT3Q9NQE9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HINT3Q9NQE9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HINT3Q9NQE9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HINT3Q9NQE9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HINT3Q9NQE9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HINT3Q9NQE9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HINT3Q9NQE9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HINT3Q9NQE9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HINT3Q9NQE9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HINT3Q9NQE9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HINT3Q9NQE9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HINT3Q9NQE9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HINT3Q9NQE9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HINT3Q9NQE9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HINT3Q9NQE9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HINT3Q9NQE9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HINT3Q9NQE9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HINT3Q9NQE9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HINT3Q9NQE9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HINT3Q9NQE9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HINT3Q9NQE9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HINT3Q9NQE9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HINT3Q9NQE9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HINT3Q9NQE9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HINT3Q9NQE9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HINT3Q9NQE9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HINT3Q9NQE9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HINT3Q9NQE9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HINT3Q9NQE9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HINT3Q9NQE9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HINT3Q9NQE9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HINT3Q9NQE9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HINT3Q9NQE9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HINT3Q9NQE9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HINT3Q9NQE9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HINT3Q9NQE9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HINT3Q9NQE9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HINT3Q9NQE9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HINT3Q9NQE9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HINT3Q9NQE9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HINT3Q9NQE9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HINT3Q9NQE9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HINT3Q9NQE9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HINT3Q9NQE9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HINT3Q9NQE9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HINT3Q9NQE9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HINT3Q9NQE9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HINT3Q9NQE9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HINT3Q9NQE9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HINT3Q9NQE9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HINT3Q9NQE9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HINT3Q9NQE9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HINT3Q9NQE9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HINT3Q9NQE9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HINT3Q9NQE9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HINT3Q9NQE9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HINT3Q9NQE9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms