Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYLDQ9NQC7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYLDQ9NQC7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYLDQ9NQC7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYLDQ9NQC7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYLDQ9NQC7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYLDQ9NQC7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYLDQ9NQC7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYLDQ9NQC7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYLDQ9NQC7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYLDQ9NQC7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYLDQ9NQC7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYLDQ9NQC7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYLDQ9NQC7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYLDQ9NQC7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CYLDQ9NQC7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYLDQ9NQC7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYLDQ9NQC7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYLDQ9NQC7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYLDQ9NQC7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYLDQ9NQC7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYLDQ9NQC7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYLDQ9NQC7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYLDQ9NQC7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYLDQ9NQC7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYLDQ9NQC7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYLDQ9NQC7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYLDQ9NQC7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYLDQ9NQC7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYLDQ9NQC7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYLDQ9NQC7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYLDQ9NQC7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYLDQ9NQC7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CYLDQ9NQC7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYLDQ9NQC7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYLDQ9NQC7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYLDQ9NQC7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYLDQ9NQC7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYLDQ9NQC7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYLDQ9NQC7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CYLDQ9NQC7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CYLDQ9NQC7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYLDQ9NQC7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYLDQ9NQC7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYLDQ9NQC7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYLDQ9NQC7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYLDQ9NQC7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYLDQ9NQC7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYLDQ9NQC7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CYLDQ9NQC7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CYLDQ9NQC7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYLDQ9NQC7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CYLDQ9NQC7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CYLDQ9NQC7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYLDQ9NQC7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CYLDQ9NQC7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms