Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCUBE2Q9NQ36 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCUBE2Q9NQ36 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCUBE2Q9NQ36 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCUBE2Q9NQ36 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SCUBE2Q9NQ36 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SCUBE2Q9NQ36 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCUBE2Q9NQ36 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCUBE2Q9NQ36 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCUBE2Q9NQ36 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCUBE2Q9NQ36 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCUBE2Q9NQ36 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCUBE2Q9NQ36 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SCUBE2Q9NQ36 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCUBE2Q9NQ36 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCUBE2Q9NQ36 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCUBE2Q9NQ36 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCUBE2Q9NQ36 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCUBE2Q9NQ36 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCUBE2Q9NQ36 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCUBE2Q9NQ36 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCUBE2Q9NQ36 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCUBE2Q9NQ36 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCUBE2Q9NQ36 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCUBE2Q9NQ36 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCUBE2Q9NQ36 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCUBE2Q9NQ36 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCUBE2Q9NQ36 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCUBE2Q9NQ36 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCUBE2Q9NQ36 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCUBE2Q9NQ36 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCUBE2Q9NQ36 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SCUBE2Q9NQ36 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCUBE2Q9NQ36 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCUBE2Q9NQ36 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCUBE2Q9NQ36 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCUBE2Q9NQ36 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCUBE2Q9NQ36 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCUBE2Q9NQ36 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCUBE2Q9NQ36 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCUBE2Q9NQ36 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCUBE2Q9NQ36 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCUBE2Q9NQ36 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCUBE2Q9NQ36 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCUBE2Q9NQ36 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCUBE2Q9NQ36 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCUBE2Q9NQ36 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCUBE2Q9NQ36 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCUBE2Q9NQ36 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCUBE2Q9NQ36 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCUBE2Q9NQ36 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCUBE2Q9NQ36 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCUBE2Q9NQ36 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCUBE2Q9NQ36 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms