Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLCO1B3Q9NPD5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLCO1B3Q9NPD5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLCO1B3Q9NPD5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLCO1B3Q9NPD5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLCO1B3Q9NPD5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLCO1B3Q9NPD5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLCO1B3Q9NPD5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLCO1B3Q9NPD5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLCO1B3Q9NPD5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLCO1B3Q9NPD5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLCO1B3Q9NPD5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLCO1B3Q9NPD5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLCO1B3Q9NPD5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLCO1B3Q9NPD5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLCO1B3Q9NPD5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLCO1B3Q9NPD5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLCO1B3Q9NPD5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLCO1B3Q9NPD5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLCO1B3Q9NPD5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLCO1B3Q9NPD5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLCO1B3Q9NPD5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLCO1B3Q9NPD5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLCO1B3Q9NPD5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLCO1B3Q9NPD5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLCO1B3Q9NPD5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLCO1B3Q9NPD5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLCO1B3Q9NPD5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLCO1B3Q9NPD5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLCO1B3Q9NPD5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLCO1B3Q9NPD5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLCO1B3Q9NPD5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLCO1B3Q9NPD5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLCO1B3Q9NPD5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLCO1B3Q9NPD5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLCO1B3Q9NPD5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLCO1B3Q9NPD5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLCO1B3Q9NPD5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLCO1B3Q9NPD5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLCO1B3Q9NPD5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLCO1B3Q9NPD5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLCO1B3Q9NPD5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLCO1B3Q9NPD5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLCO1B3Q9NPD5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLCO1B3Q9NPD5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLCO1B3Q9NPD5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLCO1B3Q9NPD5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLCO1B3Q9NPD5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLCO1B3Q9NPD5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLCO1B3Q9NPD5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLCO1B3Q9NPD5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms