Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU8

POLD4, DNA polymerase delta subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4Q9HCU8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLD4Q9HCU8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLD4Q9HCU8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLD4Q9HCU8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLD4Q9HCU8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLD4Q9HCU8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLD4Q9HCU8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLD4Q9HCU8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLD4Q9HCU8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLD4Q9HCU8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLD4Q9HCU8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLD4Q9HCU8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLD4Q9HCU8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLD4Q9HCU8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLD4Q9HCU8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLD4Q9HCU8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLD4Q9HCU8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLD4Q9HCU8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
POLD4Q9HCU8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
POLD4Q9HCU8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
POLD4Q9HCU8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLD4Q9HCU8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLD4Q9HCU8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLD4Q9HCU8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
POLD4Q9HCU8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLD4Q9HCU8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLD4Q9HCU8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLD4Q9HCU8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLD4Q9HCU8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLD4Q9HCU8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLD4Q9HCU8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLD4Q9HCU8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLD4Q9HCU8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLD4Q9HCU8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLD4Q9HCU8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLD4Q9HCU8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
POLD4Q9HCU8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLD4Q9HCU8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLD4Q9HCU8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLD4Q9HCU8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLD4Q9HCU8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLD4Q9HCU8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLD4Q9HCU8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLD4Q9HCU8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLD4Q9HCU8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLD4Q9HCU8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLD4Q9HCU8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLD4Q9HCU8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLD4Q9HCU8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLD4Q9HCU8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLD4Q9HCU8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLD4Q9HCU8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLD4Q9HCU8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLD4Q9HCU8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLD4Q9HCU8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLD4Q9HCU8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLD4Q9HCU8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLD4Q9HCU8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLD4Q9HCU8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
POLD4Q9HCU8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLD4Q9HCU8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLD4Q9HCU8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLD4Q9HCU8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLD4Q9HCU8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLD4Q9HCU8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLD4Q9HCU8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLD4Q9HCU8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLD4Q9HCU8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLD4Q9HCU8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLD4Q9HCU8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLD4Q9HCU8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLD4Q9HCU8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
POLD4Q9HCU8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLD4Q9HCU8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLD4Q9HCU8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLD4Q9HCU8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLD4Q9HCU8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLD4Q9HCU8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLD4Q9HCU8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLD4Q9HCU8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLD4Q9HCU8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLD4Q9HCU8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLD4Q9HCU8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLD4Q9HCU8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLD4Q9HCU8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLD4Q9HCU8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLD4Q9HCU8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLD4Q9HCU8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLD4Q9HCU8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
POLD4Q9HCU8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLD4Q9HCU8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLD4Q9HCU8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLD4Q9HCU8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
POLD4Q9HCU8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLD4Q9HCU8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLD4Q9HCU8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLD4Q9HCU8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLD4Q9HCU8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLD4Q9HCU8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLD4Q9HCU8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms