Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEBOXQ9HB31 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SEBOXQ9HB31 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEBOXQ9HB31 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEBOXQ9HB31 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEBOXQ9HB31 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEBOXQ9HB31 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEBOXQ9HB31 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEBOXQ9HB31 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEBOXQ9HB31 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEBOXQ9HB31 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms