Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAP6

LIN7B, Protein lin-7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7BQ9HAP6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN7BQ9HAP6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN7BQ9HAP6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN7BQ9HAP6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN7BQ9HAP6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN7BQ9HAP6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN7BQ9HAP6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN7BQ9HAP6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN7BQ9HAP6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN7BQ9HAP6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN7BQ9HAP6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN7BQ9HAP6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN7BQ9HAP6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN7BQ9HAP6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIN7BQ9HAP6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN7BQ9HAP6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN7BQ9HAP6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN7BQ9HAP6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LIN7BQ9HAP6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN7BQ9HAP6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN7BQ9HAP6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN7BQ9HAP6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN7BQ9HAP6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN7BQ9HAP6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN7BQ9HAP6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN7BQ9HAP6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN7BQ9HAP6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN7BQ9HAP6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN7BQ9HAP6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN7BQ9HAP6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN7BQ9HAP6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN7BQ9HAP6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LIN7BQ9HAP6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LIN7BQ9HAP6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN7BQ9HAP6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN7BQ9HAP6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN7BQ9HAP6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN7BQ9HAP6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN7BQ9HAP6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN7BQ9HAP6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN7BQ9HAP6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN7BQ9HAP6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN7BQ9HAP6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN7BQ9HAP6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN7BQ9HAP6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN7BQ9HAP6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN7BQ9HAP6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN7BQ9HAP6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN7BQ9HAP6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN7BQ9HAP6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN7BQ9HAP6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN7BQ9HAP6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7BQ9HAP6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7BQ9HAP6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN7BQ9HAP6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN7BQ9HAP6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN7BQ9HAP6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN7BQ9HAP6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN7BQ9HAP6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN7BQ9HAP6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN7BQ9HAP6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN7BQ9HAP6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7BQ9HAP6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7BQ9HAP6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN7BQ9HAP6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN7BQ9HAP6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIN7BQ9HAP6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN7BQ9HAP6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIN7BQ9HAP6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN7BQ9HAP6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN7BQ9HAP6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN7BQ9HAP6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN7BQ9HAP6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN7BQ9HAP6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIN7BQ9HAP6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms