Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAH1

ZNF556, Zinc finger protein 556, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF556Q9HAH1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF556Q9HAH1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF556Q9HAH1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF556Q9HAH1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF556Q9HAH1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF556Q9HAH1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF556Q9HAH1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF556Q9HAH1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF556Q9HAH1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF556Q9HAH1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF556Q9HAH1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF556Q9HAH1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF556Q9HAH1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF556Q9HAH1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF556Q9HAH1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF556Q9HAH1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF556Q9HAH1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF556Q9HAH1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF556Q9HAH1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF556Q9HAH1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF556Q9HAH1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF556Q9HAH1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF556Q9HAH1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF556Q9HAH1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF556Q9HAH1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF556Q9HAH1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF556Q9HAH1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF556Q9HAH1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF556Q9HAH1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF556Q9HAH1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF556Q9HAH1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF556Q9HAH1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF556Q9HAH1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF556Q9HAH1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF556Q9HAH1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF556Q9HAH1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF556Q9HAH1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF556Q9HAH1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF556Q9HAH1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF556Q9HAH1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF556Q9HAH1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF556Q9HAH1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF556Q9HAH1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF556Q9HAH1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF556Q9HAH1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF556Q9HAH1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF556Q9HAH1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF556Q9HAH1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF556Q9HAH1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF556Q9HAH1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF556Q9HAH1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF556Q9HAH1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms