Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W5

TRIM45, Tripartite motif-containing protein 45, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM45Q9H8W5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM45Q9H8W5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM45Q9H8W5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM45Q9H8W5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM45Q9H8W5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM45Q9H8W5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM45Q9H8W5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM45Q9H8W5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM45Q9H8W5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM45Q9H8W5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM45Q9H8W5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM45Q9H8W5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM45Q9H8W5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM45Q9H8W5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM45Q9H8W5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM45Q9H8W5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM45Q9H8W5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM45Q9H8W5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM45Q9H8W5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM45Q9H8W5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM45Q9H8W5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM45Q9H8W5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM45Q9H8W5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM45Q9H8W5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM45Q9H8W5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM45Q9H8W5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms