Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B9

EPHX3, Epoxide hydrolase 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHX3Q9H6B9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPHX3Q9H6B9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
EPHX3Q9H6B9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPHX3Q9H6B9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPHX3Q9H6B9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPHX3Q9H6B9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPHX3Q9H6B9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
EPHX3Q9H6B9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPHX3Q9H6B9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPHX3Q9H6B9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPHX3Q9H6B9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPHX3Q9H6B9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPHX3Q9H6B9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
EPHX3Q9H6B9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPHX3Q9H6B9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPHX3Q9H6B9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPHX3Q9H6B9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPHX3Q9H6B9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPHX3Q9H6B9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPHX3Q9H6B9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPHX3Q9H6B9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPHX3Q9H6B9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPHX3Q9H6B9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPHX3Q9H6B9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EPHX3Q9H6B9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EPHX3Q9H6B9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EPHX3Q9H6B9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPHX3Q9H6B9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPHX3Q9H6B9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPHX3Q9H6B9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPHX3Q9H6B9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPHX3Q9H6B9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPHX3Q9H6B9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPHX3Q9H6B9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPHX3Q9H6B9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPHX3Q9H6B9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPHX3Q9H6B9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPHX3Q9H6B9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHX3Q9H6B9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHX3Q9H6B9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHX3Q9H6B9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHX3Q9H6B9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHX3Q9H6B9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPHX3Q9H6B9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPHX3Q9H6B9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPHX3Q9H6B9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPHX3Q9H6B9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHX3Q9H6B9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHX3Q9H6B9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EPHX3Q9H6B9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPHX3Q9H6B9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPHX3Q9H6B9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EPHX3Q9H6B9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EPHX3Q9H6B9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.57■■■□□ 2
EPHX3Q9H6B9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EPHX3Q9H6B9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPHX3Q9H6B9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EPHX3Q9H6B9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EPHX3Q9H6B9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
EPHX3Q9H6B9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
EPHX3Q9H6B9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EPHX3Q9H6B9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EPHX3Q9H6B9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EPHX3Q9H6B9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHX3Q9H6B9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHX3Q9H6B9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHX3Q9H6B9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHX3Q9H6B9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHX3Q9H6B9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHX3Q9H6B9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHX3Q9H6B9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHX3Q9H6B9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHX3Q9H6B9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHX3Q9H6B9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHX3Q9H6B9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHX3Q9H6B9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHX3Q9H6B9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHX3Q9H6B9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHX3Q9H6B9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHX3Q9H6B9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHX3Q9H6B9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHX3Q9H6B9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHX3Q9H6B9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHX3Q9H6B9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EPHX3Q9H6B9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHX3Q9H6B9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHX3Q9H6B9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPHX3Q9H6B9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
EPHX3Q9H6B9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHX3Q9H6B9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHX3Q9H6B9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms