Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM12Q9H4Q4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM12Q9H4Q4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM12Q9H4Q4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM12Q9H4Q4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM12Q9H4Q4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM12Q9H4Q4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM12Q9H4Q4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM12Q9H4Q4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM12Q9H4Q4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM12Q9H4Q4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM12Q9H4Q4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM12Q9H4Q4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM12Q9H4Q4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM12Q9H4Q4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM12Q9H4Q4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM12Q9H4Q4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM12Q9H4Q4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM12Q9H4Q4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM12Q9H4Q4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM12Q9H4Q4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM12Q9H4Q4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM12Q9H4Q4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM12Q9H4Q4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM12Q9H4Q4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM12Q9H4Q4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM12Q9H4Q4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM12Q9H4Q4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM12Q9H4Q4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM12Q9H4Q4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM12Q9H4Q4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM12Q9H4Q4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM12Q9H4Q4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM12Q9H4Q4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM12Q9H4Q4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM12Q9H4Q4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM12Q9H4Q4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM12Q9H4Q4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM12Q9H4Q4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM12Q9H4Q4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM12Q9H4Q4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM12Q9H4Q4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM12Q9H4Q4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM12Q9H4Q4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM12Q9H4Q4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM12Q9H4Q4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM12Q9H4Q4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM12Q9H4Q4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM12Q9H4Q4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM12Q9H4Q4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM12Q9H4Q4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM12Q9H4Q4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM12Q9H4Q4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM12Q9H4Q4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM12Q9H4Q4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM12Q9H4Q4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms