Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Y0

ATG5, Autophagy protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG5Q9H1Y0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG5Q9H1Y0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG5Q9H1Y0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG5Q9H1Y0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG5Q9H1Y0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG5Q9H1Y0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG5Q9H1Y0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG5Q9H1Y0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG5Q9H1Y0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG5Q9H1Y0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG5Q9H1Y0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG5Q9H1Y0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG5Q9H1Y0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG5Q9H1Y0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG5Q9H1Y0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG5Q9H1Y0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATG5Q9H1Y0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG5Q9H1Y0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG5Q9H1Y0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG5Q9H1Y0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG5Q9H1Y0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG5Q9H1Y0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG5Q9H1Y0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG5Q9H1Y0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG5Q9H1Y0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG5Q9H1Y0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG5Q9H1Y0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG5Q9H1Y0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG5Q9H1Y0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG5Q9H1Y0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG5Q9H1Y0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG5Q9H1Y0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG5Q9H1Y0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG5Q9H1Y0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG5Q9H1Y0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG5Q9H1Y0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG5Q9H1Y0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG5Q9H1Y0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG5Q9H1Y0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG5Q9H1Y0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG5Q9H1Y0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG5Q9H1Y0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG5Q9H1Y0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG5Q9H1Y0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG5Q9H1Y0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG5Q9H1Y0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG5Q9H1Y0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG5Q9H1Y0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG5Q9H1Y0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG5Q9H1Y0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG5Q9H1Y0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms