Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SENP6Q9GZR1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SENP6Q9GZR1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SENP6Q9GZR1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP6Q9GZR1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP6Q9GZR1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SENP6Q9GZR1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SENP6Q9GZR1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SENP6Q9GZR1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SENP6Q9GZR1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SENP6Q9GZR1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SENP6Q9GZR1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP6Q9GZR1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SENP6Q9GZR1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP6Q9GZR1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP6Q9GZR1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP6Q9GZR1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP6Q9GZR1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP6Q9GZR1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SENP6Q9GZR1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SENP6Q9GZR1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SENP6Q9GZR1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SENP6Q9GZR1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SENP6Q9GZR1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SENP6Q9GZR1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SENP6Q9GZR1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP6Q9GZR1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP6Q9GZR1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP6Q9GZR1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP6Q9GZR1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SENP6Q9GZR1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SENP6Q9GZR1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SENP6Q9GZR1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP6Q9GZR1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP6Q9GZR1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP6Q9GZR1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP6Q9GZR1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SENP6Q9GZR1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SENP6Q9GZR1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SENP6Q9GZR1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SENP6Q9GZR1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SENP6Q9GZR1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SENP6Q9GZR1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SENP6Q9GZR1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SENP6Q9GZR1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SENP6Q9GZR1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SENP6Q9GZR1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SENP6Q9GZR1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SENP6Q9GZR1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SENP6Q9GZR1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SENP6Q9GZR1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SENP6Q9GZR1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SENP6Q9GZR1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP6Q9GZR1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP6Q9GZR1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SENP6Q9GZR1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SENP6Q9GZR1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SENP6Q9GZR1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SENP6Q9GZR1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SENP6Q9GZR1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SENP6Q9GZR1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP6Q9GZR1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP6Q9GZR1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP6Q9GZR1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SENP6Q9GZR1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SENP6Q9GZR1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SENP6Q9GZR1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SENP6Q9GZR1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SENP6Q9GZR1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SENP6Q9GZR1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP6Q9GZR1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP6Q9GZR1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP6Q9GZR1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP6Q9GZR1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP6Q9GZR1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP6Q9GZR1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP6Q9GZR1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms