Protein–RNA interactions for Protein: Q9C040

TRIM2, Tripartite motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM2Q9C040 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM2Q9C040 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM2Q9C040 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM2Q9C040 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM2Q9C040 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM2Q9C040 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM2Q9C040 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM2Q9C040 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM2Q9C040 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM2Q9C040 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM2Q9C040 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM2Q9C040 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM2Q9C040 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM2Q9C040 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM2Q9C040 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM2Q9C040 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM2Q9C040 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM2Q9C040 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM2Q9C040 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM2Q9C040 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM2Q9C040 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM2Q9C040 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM2Q9C040 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM2Q9C040 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM2Q9C040 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM2Q9C040 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM2Q9C040 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM2Q9C040 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM2Q9C040 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM2Q9C040 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM2Q9C040 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM2Q9C040 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM2Q9C040 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM2Q9C040 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM2Q9C040 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM2Q9C040 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM2Q9C040 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM2Q9C040 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM2Q9C040 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM2Q9C040 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM2Q9C040 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM2Q9C040 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM2Q9C040 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM2Q9C040 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM2Q9C040 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM2Q9C040 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM2Q9C040 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM2Q9C040 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM2Q9C040 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM2Q9C040 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM2Q9C040 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM2Q9C040 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM2Q9C040 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM2Q9C040 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM2Q9C040 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM2Q9C040 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM2Q9C040 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM2Q9C040 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM2Q9C040 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM2Q9C040 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM2Q9C040 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM2Q9C040 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM2Q9C040 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM2Q9C040 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM2Q9C040 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM2Q9C040 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM2Q9C040 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM2Q9C040 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM2Q9C040 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM2Q9C040 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM2Q9C040 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM2Q9C040 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM2Q9C040 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM2Q9C040 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM2Q9C040 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM2Q9C040 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM2Q9C040 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms