Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PITPNM3Q9BZ71 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PITPNM3Q9BZ71 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PITPNM3Q9BZ71 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PITPNM3Q9BZ71 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PITPNM3Q9BZ71 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PITPNM3Q9BZ71 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PITPNM3Q9BZ71 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PITPNM3Q9BZ71 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PITPNM3Q9BZ71 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PITPNM3Q9BZ71 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PITPNM3Q9BZ71 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PITPNM3Q9BZ71 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PITPNM3Q9BZ71 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PITPNM3Q9BZ71 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PITPNM3Q9BZ71 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PITPNM3Q9BZ71 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PITPNM3Q9BZ71 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PITPNM3Q9BZ71 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PITPNM3Q9BZ71 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PITPNM3Q9BZ71 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PITPNM3Q9BZ71 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PITPNM3Q9BZ71 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PITPNM3Q9BZ71 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PITPNM3Q9BZ71 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PITPNM3Q9BZ71 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PITPNM3Q9BZ71 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PITPNM3Q9BZ71 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PITPNM3Q9BZ71 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PITPNM3Q9BZ71 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PITPNM3Q9BZ71 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PITPNM3Q9BZ71 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PITPNM3Q9BZ71 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PITPNM3Q9BZ71 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PITPNM3Q9BZ71 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PITPNM3Q9BZ71 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PITPNM3Q9BZ71 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PITPNM3Q9BZ71 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PITPNM3Q9BZ71 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PITPNM3Q9BZ71 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PITPNM3Q9BZ71 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PITPNM3Q9BZ71 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PITPNM3Q9BZ71 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PITPNM3Q9BZ71 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PITPNM3Q9BZ71 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PITPNM3Q9BZ71 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PITPNM3Q9BZ71 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PITPNM3Q9BZ71 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PITPNM3Q9BZ71 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PITPNM3Q9BZ71 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PITPNM3Q9BZ71 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PITPNM3Q9BZ71 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PITPNM3Q9BZ71 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PITPNM3Q9BZ71 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PITPNM3Q9BZ71 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PITPNM3Q9BZ71 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PITPNM3Q9BZ71 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PITPNM3Q9BZ71 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PITPNM3Q9BZ71 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PITPNM3Q9BZ71 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PITPNM3Q9BZ71 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PITPNM3Q9BZ71 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PITPNM3Q9BZ71 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PITPNM3Q9BZ71 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PITPNM3Q9BZ71 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PITPNM3Q9BZ71 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PITPNM3Q9BZ71 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PITPNM3Q9BZ71 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PITPNM3Q9BZ71 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PITPNM3Q9BZ71 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PITPNM3Q9BZ71 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms