Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYT5

KRTAP2-2, Keratin-associated protein 2-2, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-2Q9BYT5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP2-2Q9BYT5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP2-2Q9BYT5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP2-2Q9BYT5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP2-2Q9BYT5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP2-2Q9BYT5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP2-2Q9BYT5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP2-2Q9BYT5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP2-2Q9BYT5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP2-2Q9BYT5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP2-2Q9BYT5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP2-2Q9BYT5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP2-2Q9BYT5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP2-2Q9BYT5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP2-2Q9BYT5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP2-2Q9BYT5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP2-2Q9BYT5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP2-2Q9BYT5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP2-2Q9BYT5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP2-2Q9BYT5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP2-2Q9BYT5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP2-2Q9BYT5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms