Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABARAPL3Q9BY60 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABARAPL3Q9BY60 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABARAPL3Q9BY60 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABARAPL3Q9BY60 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABARAPL3Q9BY60 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABARAPL3Q9BY60 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABARAPL3Q9BY60 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GABARAPL3Q9BY60 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABARAPL3Q9BY60 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABARAPL3Q9BY60 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABARAPL3Q9BY60 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABARAPL3Q9BY60 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABARAPL3Q9BY60 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GABARAPL3Q9BY60 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GABARAPL3Q9BY60 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABARAPL3Q9BY60 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABARAPL3Q9BY60 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABARAPL3Q9BY60 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABARAPL3Q9BY60 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABARAPL3Q9BY60 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABARAPL3Q9BY60 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABARAPL3Q9BY60 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABARAPL3Q9BY60 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABARAPL3Q9BY60 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABARAPL3Q9BY60 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABARAPL3Q9BY60 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABARAPL3Q9BY60 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABARAPL3Q9BY60 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABARAPL3Q9BY60 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABARAPL3Q9BY60 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABARAPL3Q9BY60 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABARAPL3Q9BY60 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABARAPL3Q9BY60 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABARAPL3Q9BY60 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABARAPL3Q9BY60 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABARAPL3Q9BY60 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GABARAPL3Q9BY60 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABARAPL3Q9BY60 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABARAPL3Q9BY60 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABARAPL3Q9BY60 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABARAPL3Q9BY60 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABARAPL3Q9BY60 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABARAPL3Q9BY60 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABARAPL3Q9BY60 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABARAPL3Q9BY60 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABARAPL3Q9BY60 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABARAPL3Q9BY60 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABARAPL3Q9BY60 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GABARAPL3Q9BY60 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABARAPL3Q9BY60 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABARAPL3Q9BY60 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GABARAPL3Q9BY60 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABARAPL3Q9BY60 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABARAPL3Q9BY60 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABARAPL3Q9BY60 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABARAPL3Q9BY60 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABARAPL3Q9BY60 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABARAPL3Q9BY60 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABARAPL3Q9BY60 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABARAPL3Q9BY60 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABARAPL3Q9BY60 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABARAPL3Q9BY60 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABARAPL3Q9BY60 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABARAPL3Q9BY60 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABARAPL3Q9BY60 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABARAPL3Q9BY60 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABARAPL3Q9BY60 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABARAPL3Q9BY60 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABARAPL3Q9BY60 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABARAPL3Q9BY60 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABARAPL3Q9BY60 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABARAPL3Q9BY60 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms