Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LSM14BQ9BX40 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LSM14BQ9BX40 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LSM14BQ9BX40 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LSM14BQ9BX40 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LSM14BQ9BX40 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LSM14BQ9BX40 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LSM14BQ9BX40 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LSM14BQ9BX40 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LSM14BQ9BX40 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LSM14BQ9BX40 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LSM14BQ9BX40 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LSM14BQ9BX40 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LSM14BQ9BX40 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LSM14BQ9BX40 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LSM14BQ9BX40 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LSM14BQ9BX40 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LSM14BQ9BX40 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LSM14BQ9BX40 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LSM14BQ9BX40 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LSM14BQ9BX40 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LSM14BQ9BX40 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LSM14BQ9BX40 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LSM14BQ9BX40 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LSM14BQ9BX40 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LSM14BQ9BX40 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LSM14BQ9BX40 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LSM14BQ9BX40 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LSM14BQ9BX40 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LSM14BQ9BX40 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LSM14BQ9BX40 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LSM14BQ9BX40 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LSM14BQ9BX40 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LSM14BQ9BX40 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LSM14BQ9BX40 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LSM14BQ9BX40 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LSM14BQ9BX40 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LSM14BQ9BX40 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LSM14BQ9BX40 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LSM14BQ9BX40 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LSM14BQ9BX40 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LSM14BQ9BX40 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LSM14BQ9BX40 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LSM14BQ9BX40 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LSM14BQ9BX40 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LSM14BQ9BX40 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LSM14BQ9BX40 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LSM14BQ9BX40 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LSM14BQ9BX40 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LSM14BQ9BX40 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LSM14BQ9BX40 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LSM14BQ9BX40 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LSM14BQ9BX40 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LSM14BQ9BX40 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LSM14BQ9BX40 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LSM14BQ9BX40 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LSM14BQ9BX40 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms