Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
APOL6Q9BWW8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOL6Q9BWW8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOL6Q9BWW8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOL6Q9BWW8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOL6Q9BWW8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOL6Q9BWW8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOL6Q9BWW8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOL6Q9BWW8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APOL6Q9BWW8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APOL6Q9BWW8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APOL6Q9BWW8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
APOL6Q9BWW8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
APOL6Q9BWW8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APOL6Q9BWW8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
APOL6Q9BWW8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
APOL6Q9BWW8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APOL6Q9BWW8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APOL6Q9BWW8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
APOL6Q9BWW8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
APOL6Q9BWW8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
APOL6Q9BWW8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APOL6Q9BWW8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOL6Q9BWW8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOL6Q9BWW8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APOL6Q9BWW8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APOL6Q9BWW8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APOL6Q9BWW8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APOL6Q9BWW8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APOL6Q9BWW8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
APOL6Q9BWW8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
APOL6Q9BWW8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
APOL6Q9BWW8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOL6Q9BWW8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOL6Q9BWW8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOL6Q9BWW8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOL6Q9BWW8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
APOL6Q9BWW8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APOL6Q9BWW8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOL6Q9BWW8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOL6Q9BWW8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOL6Q9BWW8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
APOL6Q9BWW8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
APOL6Q9BWW8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APOL6Q9BWW8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOL6Q9BWW8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOL6Q9BWW8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOL6Q9BWW8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOL6Q9BWW8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOL6Q9BWW8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOL6Q9BWW8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOL6Q9BWW8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APOL6Q9BWW8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
APOL6Q9BWW8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
APOL6Q9BWW8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
APOL6Q9BWW8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
APOL6Q9BWW8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
APOL6Q9BWW8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
APOL6Q9BWW8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
APOL6Q9BWW8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
APOL6Q9BWW8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
APOL6Q9BWW8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
APOL6Q9BWW8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOL6Q9BWW8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOL6Q9BWW8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOL6Q9BWW8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
APOL6Q9BWW8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
APOL6Q9BWW8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
APOL6Q9BWW8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
APOL6Q9BWW8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOL6Q9BWW8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOL6Q9BWW8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOL6Q9BWW8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APOL6Q9BWW8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APOL6Q9BWW8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOL6Q9BWW8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOL6Q9BWW8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOL6Q9BWW8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOL6Q9BWW8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms