Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM4Q9BWF3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM4Q9BWF3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM4Q9BWF3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM4Q9BWF3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM4Q9BWF3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM4Q9BWF3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM4Q9BWF3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM4Q9BWF3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM4Q9BWF3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM4Q9BWF3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBM4Q9BWF3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBM4Q9BWF3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM4Q9BWF3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM4Q9BWF3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM4Q9BWF3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM4Q9BWF3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM4Q9BWF3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM4Q9BWF3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM4Q9BWF3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM4Q9BWF3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM4Q9BWF3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM4Q9BWF3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM4Q9BWF3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM4Q9BWF3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM4Q9BWF3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM4Q9BWF3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM4Q9BWF3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM4Q9BWF3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM4Q9BWF3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM4Q9BWF3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM4Q9BWF3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM4Q9BWF3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM4Q9BWF3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM4Q9BWF3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM4Q9BWF3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM4Q9BWF3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM4Q9BWF3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM4Q9BWF3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM4Q9BWF3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM4Q9BWF3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM4Q9BWF3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM4Q9BWF3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM4Q9BWF3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM4Q9BWF3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBM4Q9BWF3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBM4Q9BWF3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBM4Q9BWF3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM4Q9BWF3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM4Q9BWF3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM4Q9BWF3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM4Q9BWF3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM4Q9BWF3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM4Q9BWF3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM4Q9BWF3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM4Q9BWF3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM4Q9BWF3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM4Q9BWF3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM4Q9BWF3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM4Q9BWF3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM4Q9BWF3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM4Q9BWF3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM4Q9BWF3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM4Q9BWF3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM4Q9BWF3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBM4Q9BWF3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBM4Q9BWF3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBM4Q9BWF3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBM4Q9BWF3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM4Q9BWF3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM4Q9BWF3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM4Q9BWF3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM4Q9BWF3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM4Q9BWF3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM4Q9BWF3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM4Q9BWF3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM4Q9BWF3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM4Q9BWF3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM4Q9BWF3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM4Q9BWF3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms