Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REPIN1Q9BWE0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REPIN1Q9BWE0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REPIN1Q9BWE0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REPIN1Q9BWE0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REPIN1Q9BWE0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REPIN1Q9BWE0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REPIN1Q9BWE0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms