Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP58Q9BVL2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP58Q9BVL2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP58Q9BVL2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP58Q9BVL2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP58Q9BVL2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP58Q9BVL2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP58Q9BVL2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP58Q9BVL2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP58Q9BVL2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP58Q9BVL2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP58Q9BVL2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP58Q9BVL2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP58Q9BVL2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP58Q9BVL2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP58Q9BVL2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP58Q9BVL2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP58Q9BVL2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP58Q9BVL2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP58Q9BVL2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP58Q9BVL2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP58Q9BVL2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP58Q9BVL2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP58Q9BVL2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUP58Q9BVL2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP58Q9BVL2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP58Q9BVL2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP58Q9BVL2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP58Q9BVL2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP58Q9BVL2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP58Q9BVL2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP58Q9BVL2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP58Q9BVL2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP58Q9BVL2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP58Q9BVL2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP58Q9BVL2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP58Q9BVL2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP58Q9BVL2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP58Q9BVL2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP58Q9BVL2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP58Q9BVL2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP58Q9BVL2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP58Q9BVL2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP58Q9BVL2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP58Q9BVL2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP58Q9BVL2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP58Q9BVL2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP58Q9BVL2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP58Q9BVL2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP58Q9BVL2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP58Q9BVL2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP58Q9BVL2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP58Q9BVL2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP58Q9BVL2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP58Q9BVL2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP58Q9BVL2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP58Q9BVL2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP58Q9BVL2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP58Q9BVL2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP58Q9BVL2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP58Q9BVL2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP58Q9BVL2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms