Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM109Q9BVC6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM109Q9BVC6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM109Q9BVC6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM109Q9BVC6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM109Q9BVC6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM109Q9BVC6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM109Q9BVC6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM109Q9BVC6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM109Q9BVC6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM109Q9BVC6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TMEM109Q9BVC6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM109Q9BVC6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM109Q9BVC6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM109Q9BVC6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM109Q9BVC6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM109Q9BVC6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM109Q9BVC6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM109Q9BVC6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM109Q9BVC6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM109Q9BVC6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM109Q9BVC6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM109Q9BVC6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM109Q9BVC6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM109Q9BVC6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM109Q9BVC6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM109Q9BVC6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM109Q9BVC6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM109Q9BVC6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM109Q9BVC6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM109Q9BVC6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM109Q9BVC6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM109Q9BVC6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM109Q9BVC6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM109Q9BVC6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM109Q9BVC6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM109Q9BVC6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM109Q9BVC6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM109Q9BVC6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM109Q9BVC6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM109Q9BVC6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM109Q9BVC6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM109Q9BVC6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM109Q9BVC6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM109Q9BVC6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM109Q9BVC6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM109Q9BVC6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM109Q9BVC6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM109Q9BVC6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM109Q9BVC6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM109Q9BVC6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM109Q9BVC6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM109Q9BVC6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM109Q9BVC6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM109Q9BVC6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM109Q9BVC6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms