Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MKNK1Q9BUB5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MKNK1Q9BUB5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MKNK1Q9BUB5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MKNK1Q9BUB5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKNK1Q9BUB5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKNK1Q9BUB5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKNK1Q9BUB5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKNK1Q9BUB5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKNK1Q9BUB5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MKNK1Q9BUB5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKNK1Q9BUB5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKNK1Q9BUB5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MKNK1Q9BUB5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MKNK1Q9BUB5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MKNK1Q9BUB5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MKNK1Q9BUB5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MKNK1Q9BUB5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MKNK1Q9BUB5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MKNK1Q9BUB5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MKNK1Q9BUB5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MKNK1Q9BUB5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MKNK1Q9BUB5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKNK1Q9BUB5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKNK1Q9BUB5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKNK1Q9BUB5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKNK1Q9BUB5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKNK1Q9BUB5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKNK1Q9BUB5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKNK1Q9BUB5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKNK1Q9BUB5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MKNK1Q9BUB5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MKNK1Q9BUB5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MKNK1Q9BUB5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MKNK1Q9BUB5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MKNK1Q9BUB5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MKNK1Q9BUB5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
MKNK1Q9BUB5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MKNK1Q9BUB5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MKNK1Q9BUB5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKNK1Q9BUB5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKNK1Q9BUB5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MKNK1Q9BUB5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MKNK1Q9BUB5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MKNK1Q9BUB5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKNK1Q9BUB5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MKNK1Q9BUB5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MKNK1Q9BUB5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MKNK1Q9BUB5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MKNK1Q9BUB5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MKNK1Q9BUB5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MKNK1Q9BUB5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MKNK1Q9BUB5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms