Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CRACR2AQ9BSW2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CRACR2AQ9BSW2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRACR2AQ9BSW2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRACR2AQ9BSW2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CRACR2AQ9BSW2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CRACR2AQ9BSW2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CRACR2AQ9BSW2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRACR2AQ9BSW2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRACR2AQ9BSW2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRACR2AQ9BSW2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRACR2AQ9BSW2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRACR2AQ9BSW2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRACR2AQ9BSW2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRACR2AQ9BSW2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRACR2AQ9BSW2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRACR2AQ9BSW2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRACR2AQ9BSW2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRACR2AQ9BSW2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRACR2AQ9BSW2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRACR2AQ9BSW2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRACR2AQ9BSW2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRACR2AQ9BSW2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRACR2AQ9BSW2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CRACR2AQ9BSW2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRACR2AQ9BSW2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRACR2AQ9BSW2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRACR2AQ9BSW2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRACR2AQ9BSW2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRACR2AQ9BSW2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRACR2AQ9BSW2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRACR2AQ9BSW2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRACR2AQ9BSW2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRACR2AQ9BSW2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRACR2AQ9BSW2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRACR2AQ9BSW2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRACR2AQ9BSW2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRACR2AQ9BSW2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRACR2AQ9BSW2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRACR2AQ9BSW2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRACR2AQ9BSW2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRACR2AQ9BSW2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRACR2AQ9BSW2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRACR2AQ9BSW2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRACR2AQ9BSW2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRACR2AQ9BSW2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRACR2AQ9BSW2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRACR2AQ9BSW2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CRACR2AQ9BSW2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CRACR2AQ9BSW2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CRACR2AQ9BSW2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRACR2AQ9BSW2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CRACR2AQ9BSW2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRACR2AQ9BSW2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRACR2AQ9BSW2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRACR2AQ9BSW2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRACR2AQ9BSW2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRACR2AQ9BSW2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRACR2AQ9BSW2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRACR2AQ9BSW2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRACR2AQ9BSW2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRACR2AQ9BSW2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRACR2AQ9BSW2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRACR2AQ9BSW2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRACR2AQ9BSW2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRACR2AQ9BSW2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRACR2AQ9BSW2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRACR2AQ9BSW2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRACR2AQ9BSW2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRACR2AQ9BSW2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CRACR2AQ9BSW2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRACR2AQ9BSW2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRACR2AQ9BSW2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRACR2AQ9BSW2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRACR2AQ9BSW2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRACR2AQ9BSW2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms