Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM56Q9BRZ2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM56Q9BRZ2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM56Q9BRZ2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM56Q9BRZ2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM56Q9BRZ2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM56Q9BRZ2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM56Q9BRZ2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM56Q9BRZ2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM56Q9BRZ2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM56Q9BRZ2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM56Q9BRZ2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM56Q9BRZ2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM56Q9BRZ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM56Q9BRZ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM56Q9BRZ2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM56Q9BRZ2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM56Q9BRZ2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM56Q9BRZ2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM56Q9BRZ2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM56Q9BRZ2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM56Q9BRZ2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM56Q9BRZ2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM56Q9BRZ2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM56Q9BRZ2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM56Q9BRZ2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM56Q9BRZ2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM56Q9BRZ2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM56Q9BRZ2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM56Q9BRZ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM56Q9BRZ2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms