Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC39A3Q9BRY0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC39A3Q9BRY0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC39A3Q9BRY0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC39A3Q9BRY0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC39A3Q9BRY0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC39A3Q9BRY0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC39A3Q9BRY0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC39A3Q9BRY0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC39A3Q9BRY0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC39A3Q9BRY0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC39A3Q9BRY0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC39A3Q9BRY0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC39A3Q9BRY0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC39A3Q9BRY0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC39A3Q9BRY0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC39A3Q9BRY0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC39A3Q9BRY0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC39A3Q9BRY0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC39A3Q9BRY0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC39A3Q9BRY0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC39A3Q9BRY0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC39A3Q9BRY0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A3Q9BRY0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A3Q9BRY0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A3Q9BRY0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A3Q9BRY0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A3Q9BRY0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC39A3Q9BRY0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC39A3Q9BRY0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A3Q9BRY0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A3Q9BRY0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A3Q9BRY0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC39A3Q9BRY0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC39A3Q9BRY0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC39A3Q9BRY0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC39A3Q9BRY0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC39A3Q9BRY0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC39A3Q9BRY0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC39A3Q9BRY0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC39A3Q9BRY0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC39A3Q9BRY0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC39A3Q9BRY0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC39A3Q9BRY0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC39A3Q9BRY0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC39A3Q9BRY0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC39A3Q9BRY0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC39A3Q9BRY0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC39A3Q9BRY0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC39A3Q9BRY0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC39A3Q9BRY0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC39A3Q9BRY0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC39A3Q9BRY0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC39A3Q9BRY0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC39A3Q9BRY0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC39A3Q9BRY0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC39A3Q9BRY0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC39A3Q9BRY0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC39A3Q9BRY0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC39A3Q9BRY0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC39A3Q9BRY0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC39A3Q9BRY0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC39A3Q9BRY0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC39A3Q9BRY0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC39A3Q9BRY0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC39A3Q9BRY0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC39A3Q9BRY0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A3Q9BRY0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A3Q9BRY0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC39A3Q9BRY0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC39A3Q9BRY0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC39A3Q9BRY0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC39A3Q9BRY0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC39A3Q9BRY0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC39A3Q9BRY0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC39A3Q9BRY0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms