Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZSWIM1Q9BR11 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZSWIM1Q9BR11 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZSWIM1Q9BR11 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZSWIM1Q9BR11 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSWIM1Q9BR11 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSWIM1Q9BR11 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSWIM1Q9BR11 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSWIM1Q9BR11 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZSWIM1Q9BR11 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZSWIM1Q9BR11 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZSWIM1Q9BR11 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZSWIM1Q9BR11 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZSWIM1Q9BR11 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZSWIM1Q9BR11 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZSWIM1Q9BR11 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ZSWIM1Q9BR11 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZSWIM1Q9BR11 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZSWIM1Q9BR11 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZSWIM1Q9BR11 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZSWIM1Q9BR11 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ZSWIM1Q9BR11 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSWIM1Q9BR11 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSWIM1Q9BR11 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSWIM1Q9BR11 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSWIM1Q9BR11 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSWIM1Q9BR11 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSWIM1Q9BR11 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSWIM1Q9BR11 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZSWIM1Q9BR11 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZSWIM1Q9BR11 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZSWIM1Q9BR11 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
ZSWIM1Q9BR11 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZSWIM1Q9BR11 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZSWIM1Q9BR11 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZSWIM1Q9BR11 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZSWIM1Q9BR11 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZSWIM1Q9BR11 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZSWIM1Q9BR11 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZSWIM1Q9BR11 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZSWIM1Q9BR11 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZSWIM1Q9BR11 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZSWIM1Q9BR11 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZSWIM1Q9BR11 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZSWIM1Q9BR11 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZSWIM1Q9BR11 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZSWIM1Q9BR11 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZSWIM1Q9BR11 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZSWIM1Q9BR11 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZSWIM1Q9BR11 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ZSWIM1Q9BR11 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZSWIM1Q9BR11 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZSWIM1Q9BR11 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZSWIM1Q9BR11 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZSWIM1Q9BR11 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZSWIM1Q9BR11 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZSWIM1Q9BR11 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZSWIM1Q9BR11 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ZSWIM1Q9BR11 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZSWIM1Q9BR11 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZSWIM1Q9BR11 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZSWIM1Q9BR11 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZSWIM1Q9BR11 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSWIM1Q9BR11 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSWIM1Q9BR11 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSWIM1Q9BR11 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSWIM1Q9BR11 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSWIM1Q9BR11 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSWIM1Q9BR11 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSWIM1Q9BR11 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSWIM1Q9BR11 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSWIM1Q9BR11 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZSWIM1Q9BR11 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZSWIM1Q9BR11 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZSWIM1Q9BR11 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZSWIM1Q9BR11 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZSWIM1Q9BR11 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms