Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SLF1Q9BQI6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SLF1Q9BQI6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SLF1Q9BQI6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
SLF1Q9BQI6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SLF1Q9BQI6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SLF1Q9BQI6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SLF1Q9BQI6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SLF1Q9BQI6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SLF1Q9BQI6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SLF1Q9BQI6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SLF1Q9BQI6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SLF1Q9BQI6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SLF1Q9BQI6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SLF1Q9BQI6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SLF1Q9BQI6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SLF1Q9BQI6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SLF1Q9BQI6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SLF1Q9BQI6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SLF1Q9BQI6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SLF1Q9BQI6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SLF1Q9BQI6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SLF1Q9BQI6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SLF1Q9BQI6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SLF1Q9BQI6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SLF1Q9BQI6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SLF1Q9BQI6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SLF1Q9BQI6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SLF1Q9BQI6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SLF1Q9BQI6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SLF1Q9BQI6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SLF1Q9BQI6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SLF1Q9BQI6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SLF1Q9BQI6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SLF1Q9BQI6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SLF1Q9BQI6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLF1Q9BQI6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLF1Q9BQI6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SLF1Q9BQI6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SLF1Q9BQI6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SLF1Q9BQI6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLF1Q9BQI6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLF1Q9BQI6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLF1Q9BQI6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLF1Q9BQI6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SLF1Q9BQI6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SLF1Q9BQI6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLF1Q9BQI6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLF1Q9BQI6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLF1Q9BQI6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLF1Q9BQI6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLF1Q9BQI6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SLF1Q9BQI6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLF1Q9BQI6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLF1Q9BQI6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLF1Q9BQI6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SLF1Q9BQI6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLF1Q9BQI6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SLF1Q9BQI6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLF1Q9BQI6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLF1Q9BQI6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLF1Q9BQI6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SLF1Q9BQI6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLF1Q9BQI6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLF1Q9BQI6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLF1Q9BQI6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLF1Q9BQI6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLF1Q9BQI6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLF1Q9BQI6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLF1Q9BQI6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SLF1Q9BQI6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SLF1Q9BQI6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
SLF1Q9BQI6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SLF1Q9BQI6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SLF1Q9BQI6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SLF1Q9BQI6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SLF1Q9BQI6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SLF1Q9BQI6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SLF1Q9BQI6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SLF1Q9BQI6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms