Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HINFPQ9BQA5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HINFPQ9BQA5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HINFPQ9BQA5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HINFPQ9BQA5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HINFPQ9BQA5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HINFPQ9BQA5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HINFPQ9BQA5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HINFPQ9BQA5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HINFPQ9BQA5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HINFPQ9BQA5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HINFPQ9BQA5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HINFPQ9BQA5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HINFPQ9BQA5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HINFPQ9BQA5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HINFPQ9BQA5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HINFPQ9BQA5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HINFPQ9BQA5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HINFPQ9BQA5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HINFPQ9BQA5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HINFPQ9BQA5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HINFPQ9BQA5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HINFPQ9BQA5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HINFPQ9BQA5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HINFPQ9BQA5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HINFPQ9BQA5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HINFPQ9BQA5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HINFPQ9BQA5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HINFPQ9BQA5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HINFPQ9BQA5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HINFPQ9BQA5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HINFPQ9BQA5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HINFPQ9BQA5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HINFPQ9BQA5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HINFPQ9BQA5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HINFPQ9BQA5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HINFPQ9BQA5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HINFPQ9BQA5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HINFPQ9BQA5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HINFPQ9BQA5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HINFPQ9BQA5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HINFPQ9BQA5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HINFPQ9BQA5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HINFPQ9BQA5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HINFPQ9BQA5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HINFPQ9BQA5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HINFPQ9BQA5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HINFPQ9BQA5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HINFPQ9BQA5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HINFPQ9BQA5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HINFPQ9BQA5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HINFPQ9BQA5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HINFPQ9BQA5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HINFPQ9BQA5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HINFPQ9BQA5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HINFPQ9BQA5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HINFPQ9BQA5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HINFPQ9BQA5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HINFPQ9BQA5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HINFPQ9BQA5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HINFPQ9BQA5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HINFPQ9BQA5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HINFPQ9BQA5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HINFPQ9BQA5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HINFPQ9BQA5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HINFPQ9BQA5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HINFPQ9BQA5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HINFPQ9BQA5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HINFPQ9BQA5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HINFPQ9BQA5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HINFPQ9BQA5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HINFPQ9BQA5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HINFPQ9BQA5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HINFPQ9BQA5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HINFPQ9BQA5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HINFPQ9BQA5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HINFPQ9BQA5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HINFPQ9BQA5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HINFPQ9BQA5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HINFPQ9BQA5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HINFPQ9BQA5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HINFPQ9BQA5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HINFPQ9BQA5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HINFPQ9BQA5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HINFPQ9BQA5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HINFPQ9BQA5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HINFPQ9BQA5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HINFPQ9BQA5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HINFPQ9BQA5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HINFPQ9BQA5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HINFPQ9BQA5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms