Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TSG101Q99816 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TSG101Q99816 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TSG101Q99816 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TSG101Q99816 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSG101Q99816 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSG101Q99816 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TSG101Q99816 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSG101Q99816 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSG101Q99816 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSG101Q99816 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSG101Q99816 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSG101Q99816 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSG101Q99816 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TSG101Q99816 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TSG101Q99816 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSG101Q99816 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TSG101Q99816 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TSG101Q99816 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TSG101Q99816 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TSG101Q99816 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TSG101Q99816 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TSG101Q99816 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSG101Q99816 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TSG101Q99816 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TSG101Q99816 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TSG101Q99816 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TSG101Q99816 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TSG101Q99816 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TSG101Q99816 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TSG101Q99816 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TSG101Q99816 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TSG101Q99816 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TSG101Q99816 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TSG101Q99816 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TSG101Q99816 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TSG101Q99816 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TSG101Q99816 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TSG101Q99816 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TSG101Q99816 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TSG101Q99816 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TSG101Q99816 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TSG101Q99816 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TSG101Q99816 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TSG101Q99816 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TSG101Q99816 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TSG101Q99816 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSG101Q99816 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSG101Q99816 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSG101Q99816 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSG101Q99816 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSG101Q99816 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSG101Q99816 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSG101Q99816 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSG101Q99816 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSG101Q99816 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TSG101Q99816 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSG101Q99816 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSG101Q99816 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TSG101Q99816 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TSG101Q99816 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSG101Q99816 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSG101Q99816 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TSG101Q99816 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSG101Q99816 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSG101Q99816 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSG101Q99816 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSG101Q99816 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSG101Q99816 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSG101Q99816 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSG101Q99816 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSG101Q99816 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSG101Q99816 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSG101Q99816 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSG101Q99816 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSG101Q99816 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TSG101Q99816 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TSG101Q99816 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSG101Q99816 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSG101Q99816 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSG101Q99816 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TSG101Q99816 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TSG101Q99816 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSG101Q99816 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSG101Q99816 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSG101Q99816 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSG101Q99816 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSG101Q99816 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSG101Q99816 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSG101Q99816 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSG101Q99816 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TSG101Q99816 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TSG101Q99816 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TSG101Q99816 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TSG101Q99816 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSG101Q99816 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSG101Q99816 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TSG101Q99816 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSG101Q99816 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSG101Q99816 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms