Protein–RNA interactions for Protein: Q99805

TM9SF2, Transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2Q99805 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM9SF2Q99805 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM9SF2Q99805 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM9SF2Q99805 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM9SF2Q99805 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM9SF2Q99805 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM9SF2Q99805 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM9SF2Q99805 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM9SF2Q99805 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM9SF2Q99805 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM9SF2Q99805 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM9SF2Q99805 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM9SF2Q99805 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM9SF2Q99805 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM9SF2Q99805 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM9SF2Q99805 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM9SF2Q99805 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM9SF2Q99805 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM9SF2Q99805 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM9SF2Q99805 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM9SF2Q99805 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM9SF2Q99805 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM9SF2Q99805 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TM9SF2Q99805 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM9SF2Q99805 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM9SF2Q99805 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM9SF2Q99805 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM9SF2Q99805 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM9SF2Q99805 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM9SF2Q99805 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM9SF2Q99805 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM9SF2Q99805 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM9SF2Q99805 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TM9SF2Q99805 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM9SF2Q99805 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM9SF2Q99805 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM9SF2Q99805 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM9SF2Q99805 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM9SF2Q99805 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM9SF2Q99805 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM9SF2Q99805 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM9SF2Q99805 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM9SF2Q99805 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM9SF2Q99805 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM9SF2Q99805 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM9SF2Q99805 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM9SF2Q99805 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM9SF2Q99805 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TM9SF2Q99805 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM9SF2Q99805 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM9SF2Q99805 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM9SF2Q99805 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TM9SF2Q99805 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM9SF2Q99805 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM9SF2Q99805 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM9SF2Q99805 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM9SF2Q99805 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM9SF2Q99805 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM9SF2Q99805 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM9SF2Q99805 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM9SF2Q99805 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM9SF2Q99805 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM9SF2Q99805 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM9SF2Q99805 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM9SF2Q99805 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM9SF2Q99805 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM9SF2Q99805 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM9SF2Q99805 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM9SF2Q99805 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms