Protein–RNA interactions for Protein: Q99619

SPSB2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB2Q99619 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPSB2Q99619 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPSB2Q99619 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPSB2Q99619 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPSB2Q99619 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPSB2Q99619 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPSB2Q99619 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPSB2Q99619 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPSB2Q99619 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPSB2Q99619 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPSB2Q99619 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPSB2Q99619 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPSB2Q99619 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPSB2Q99619 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPSB2Q99619 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPSB2Q99619 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPSB2Q99619 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPSB2Q99619 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPSB2Q99619 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPSB2Q99619 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPSB2Q99619 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPSB2Q99619 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPSB2Q99619 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPSB2Q99619 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPSB2Q99619 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPSB2Q99619 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPSB2Q99619 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPSB2Q99619 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPSB2Q99619 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPSB2Q99619 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPSB2Q99619 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPSB2Q99619 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPSB2Q99619 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPSB2Q99619 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPSB2Q99619 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPSB2Q99619 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPSB2Q99619 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPSB2Q99619 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPSB2Q99619 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPSB2Q99619 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPSB2Q99619 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SPSB2Q99619 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPSB2Q99619 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPSB2Q99619 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPSB2Q99619 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPSB2Q99619 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPSB2Q99619 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPSB2Q99619 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPSB2Q99619 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPSB2Q99619 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPSB2Q99619 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPSB2Q99619 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SPSB2Q99619 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SPSB2Q99619 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SPSB2Q99619 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPSB2Q99619 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPSB2Q99619 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPSB2Q99619 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPSB2Q99619 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPSB2Q99619 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPSB2Q99619 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPSB2Q99619 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPSB2Q99619 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPSB2Q99619 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPSB2Q99619 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPSB2Q99619 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPSB2Q99619 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPSB2Q99619 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPSB2Q99619 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPSB2Q99619 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPSB2Q99619 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPSB2Q99619 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPSB2Q99619 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPSB2Q99619 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPSB2Q99619 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPSB2Q99619 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms