Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF3CQ99613 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF3CQ99613 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF3CQ99613 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF3CQ99613 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF3CQ99613 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF3CQ99613 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF3CQ99613 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF3CQ99613 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF3CQ99613 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF3CQ99613 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF3CQ99613 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF3CQ99613 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF3CQ99613 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF3CQ99613 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EIF3CQ99613 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EIF3CQ99613 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EIF3CQ99613 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EIF3CQ99613 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EIF3CQ99613 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF3CQ99613 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF3CQ99613 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF3CQ99613 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF3CQ99613 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF3CQ99613 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EIF3CQ99613 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EIF3CQ99613 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EIF3CQ99613 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EIF3CQ99613 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EIF3CQ99613 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF3CQ99613 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF3CQ99613 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF3CQ99613 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EIF3CQ99613 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
EIF3CQ99613 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EIF3CQ99613 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EIF3CQ99613 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF3CQ99613 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3CQ99613 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3CQ99613 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3CQ99613 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3CQ99613 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3CQ99613 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3CQ99613 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3CQ99613 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF3CQ99613 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF3CQ99613 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3CQ99613 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3CQ99613 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3CQ99613 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3CQ99613 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF3CQ99613 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF3CQ99613 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF3CQ99613 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF3CQ99613 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF3CQ99613 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF3CQ99613 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EIF3CQ99613 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EIF3CQ99613 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF3CQ99613 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF3CQ99613 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF3CQ99613 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF3CQ99613 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF3CQ99613 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF3CQ99613 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF3CQ99613 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF3CQ99613 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF3CQ99613 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF3CQ99613 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EIF3CQ99613 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EIF3CQ99613 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3CQ99613 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3CQ99613 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3CQ99613 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF3CQ99613 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3CQ99613 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3CQ99613 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EIF3CQ99613 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EIF3CQ99613 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EIF3CQ99613 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EIF3CQ99613 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EIF3CQ99613 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF3CQ99613 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF3CQ99613 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF3CQ99613 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF3CQ99613 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF3CQ99613 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EIF3CQ99613 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF3CQ99613 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF3CQ99613 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF3CQ99613 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF3CQ99613 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF3CQ99613 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EIF3CQ99613 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EIF3CQ99613 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF3CQ99613 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF3CQ99613 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF3CQ99613 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF3CQ99613 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF3CQ99613 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms