Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
MMS19Q96T76 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MMS19Q96T76 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MMS19Q96T76 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MMS19Q96T76 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MMS19Q96T76 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MMS19Q96T76 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MMS19Q96T76 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MMS19Q96T76 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MMS19Q96T76 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MMS19Q96T76 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MMS19Q96T76 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MMS19Q96T76 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MMS19Q96T76 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MMS19Q96T76 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MMS19Q96T76 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MMS19Q96T76 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MMS19Q96T76 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MMS19Q96T76 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MMS19Q96T76 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MMS19Q96T76 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MMS19Q96T76 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MMS19Q96T76 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MMS19Q96T76 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MMS19Q96T76 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MMS19Q96T76 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MMS19Q96T76 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MMS19Q96T76 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MMS19Q96T76 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MMS19Q96T76 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MMS19Q96T76 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MMS19Q96T76 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MMS19Q96T76 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MMS19Q96T76 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MMS19Q96T76 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MMS19Q96T76 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MMS19Q96T76 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MMS19Q96T76 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MMS19Q96T76 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MMS19Q96T76 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MMS19Q96T76 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MMS19Q96T76 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MMS19Q96T76 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MMS19Q96T76 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MMS19Q96T76 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MMS19Q96T76 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MMS19Q96T76 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MMS19Q96T76 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MMS19Q96T76 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MMS19Q96T76 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MMS19Q96T76 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MMS19Q96T76 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MMS19Q96T76 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MMS19Q96T76 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MMS19Q96T76 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MMS19Q96T76 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MMS19Q96T76 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MMS19Q96T76 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MMS19Q96T76 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MMS19Q96T76 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MMS19Q96T76 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MMS19Q96T76 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MMS19Q96T76 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MMS19Q96T76 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MMS19Q96T76 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MMS19Q96T76 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MMS19Q96T76 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MMS19Q96T76 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MMS19Q96T76 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MMS19Q96T76 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MMS19Q96T76 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MMS19Q96T76 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MMS19Q96T76 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MMS19Q96T76 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MMS19Q96T76 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MMS19Q96T76 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MMS19Q96T76 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MMS19Q96T76 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MMS19Q96T76 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MMS19Q96T76 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MMS19Q96T76 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MMS19Q96T76 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MMS19Q96T76 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MMS19Q96T76 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MMS19Q96T76 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MMS19Q96T76 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MMS19Q96T76 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MMS19Q96T76 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MMS19Q96T76 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms