Protein–RNA interactions for Protein: Q96T54

KCNK17, Potassium channel subfamily K member 17, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK17Q96T54 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK17Q96T54 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK17Q96T54 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK17Q96T54 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK17Q96T54 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK17Q96T54 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK17Q96T54 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK17Q96T54 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK17Q96T54 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK17Q96T54 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK17Q96T54 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK17Q96T54 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK17Q96T54 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNK17Q96T54 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNK17Q96T54 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNK17Q96T54 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNK17Q96T54 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK17Q96T54 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNK17Q96T54 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK17Q96T54 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK17Q96T54 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNK17Q96T54 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNK17Q96T54 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNK17Q96T54 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNK17Q96T54 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNK17Q96T54 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNK17Q96T54 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNK17Q96T54 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK17Q96T54 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK17Q96T54 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK17Q96T54 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNK17Q96T54 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNK17Q96T54 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNK17Q96T54 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNK17Q96T54 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNK17Q96T54 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK17Q96T54 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK17Q96T54 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK17Q96T54 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK17Q96T54 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK17Q96T54 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK17Q96T54 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK17Q96T54 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK17Q96T54 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK17Q96T54 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK17Q96T54 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNK17Q96T54 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNK17Q96T54 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK17Q96T54 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK17Q96T54 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK17Q96T54 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK17Q96T54 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK17Q96T54 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK17Q96T54 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK17Q96T54 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK17Q96T54 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK17Q96T54 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK17Q96T54 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK17Q96T54 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK17Q96T54 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNK17Q96T54 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNK17Q96T54 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNK17Q96T54 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK17Q96T54 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK17Q96T54 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK17Q96T54 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK17Q96T54 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK17Q96T54 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNK17Q96T54 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNK17Q96T54 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK17Q96T54 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK17Q96T54 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK17Q96T54 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK17Q96T54 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK17Q96T54 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms