Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSSK3Q96PN8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSSK3Q96PN8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSSK3Q96PN8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSSK3Q96PN8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSSK3Q96PN8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSSK3Q96PN8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSSK3Q96PN8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSSK3Q96PN8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSSK3Q96PN8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSSK3Q96PN8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSSK3Q96PN8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSSK3Q96PN8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSSK3Q96PN8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSSK3Q96PN8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSSK3Q96PN8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSSK3Q96PN8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSSK3Q96PN8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSSK3Q96PN8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSSK3Q96PN8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSSK3Q96PN8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSSK3Q96PN8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSSK3Q96PN8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSSK3Q96PN8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSSK3Q96PN8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSSK3Q96PN8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSSK3Q96PN8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSSK3Q96PN8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSSK3Q96PN8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSSK3Q96PN8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSSK3Q96PN8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSSK3Q96PN8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSSK3Q96PN8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSSK3Q96PN8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSSK3Q96PN8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSSK3Q96PN8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSSK3Q96PN8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSSK3Q96PN8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSSK3Q96PN8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSSK3Q96PN8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSSK3Q96PN8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms