Protein–RNA interactions for Protein: Q96PF2

TSSK2, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK2Q96PF2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK2Q96PF2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK2Q96PF2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK2Q96PF2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK2Q96PF2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK2Q96PF2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK2Q96PF2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK2Q96PF2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK2Q96PF2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK2Q96PF2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK2Q96PF2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK2Q96PF2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSSK2Q96PF2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK2Q96PF2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSSK2Q96PF2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSSK2Q96PF2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK2Q96PF2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK2Q96PF2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK2Q96PF2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK2Q96PF2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK2Q96PF2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK2Q96PF2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK2Q96PF2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK2Q96PF2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK2Q96PF2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK2Q96PF2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK2Q96PF2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK2Q96PF2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK2Q96PF2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms