Protein–RNA interactions for Protein: Q96NJ1

Uncharacterized protein FLJ30774, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96NJ1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q96NJ1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q96NJ1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q96NJ1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q96NJ1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q96NJ1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q96NJ1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q96NJ1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q96NJ1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q96NJ1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q96NJ1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q96NJ1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q96NJ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q96NJ1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q96NJ1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q96NJ1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q96NJ1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q96NJ1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q96NJ1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q96NJ1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q96NJ1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Q96NJ1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q96NJ1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q96NJ1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q96NJ1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q96NJ1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q96NJ1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q96NJ1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q96NJ1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q96NJ1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q96NJ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q96NJ1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q96NJ1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q96NJ1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q96NJ1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q96NJ1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q96NJ1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q96NJ1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q96NJ1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q96NJ1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q96NJ1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q96NJ1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q96NJ1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q96NJ1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q96NJ1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q96NJ1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q96NJ1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q96NJ1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q96NJ1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q96NJ1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q96NJ1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q96NJ1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q96NJ1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q96NJ1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q96NJ1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q96NJ1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q96NJ1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q96NJ1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q96NJ1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q96NJ1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q96NJ1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q96NJ1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q96NJ1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q96NJ1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q96NJ1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q96NJ1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q96NJ1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q96NJ1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q96NJ1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q96NJ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q96NJ1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q96NJ1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q96NJ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q96NJ1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q96NJ1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q96NJ1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q96NJ1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q96NJ1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q96NJ1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q96NJ1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q96NJ1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q96NJ1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q96NJ1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q96NJ1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q96NJ1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q96NJ1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q96NJ1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q96NJ1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q96NJ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q96NJ1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q96NJ1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q96NJ1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q96NJ1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q96NJ1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q96NJ1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q96NJ1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q96NJ1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q96NJ1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q96NJ1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q96NJ1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.1 ms